Mục tiêu nghiên cứu của đề tài "Pháp nhân tôn giáo ở Việt Nam - Những vấn đề đặt ra hiện nay" nhằm làm rõ vấn đề pháp nhân tôn giáo, quá trình công nhận pháp nhân tôn giáo ở Việt Nam thời kỳ đổi mới; đồng thời xác định các vấn đề đang đặt ra để đề xuất những giải pháp trong việc công nhận pháp nhân tôn giáo liên quan đến công tác quản lý nhà nước trong thời gian tới.